1992 yılında üniversitenin kuruluşunda Fen-Edebiyat Fakültesi bünyesinde açılan bölümler arasında olmasına rağmen, Aralık 1997’de Arkeoloji ve Sanat Tarihi Bölümü olarak faaliyete geçmiştir. 8 Mayıs 2002 yılında Üniversitelerarası Kurul tarafından Arkeoloji Bölümü olarak ayrılmıştır. Bölümde; Prehistorya, Önasya ve Protohistorya, Klasik Arkeoloji olmak üzere 3 Anabilim Dalı vardır. Lisans, Yüksek Lisans ve Doktora programları açıktır. Öğrenim dili Türkçe'dir. Öğrenim süresi ise 4 yıldır.

Bu programın temel amacı, öğrencilere insanlığın geçmişini ve kültürlerini, Paleolitik'ten başlayarak Anadolu başta olmak üzere Mezopotamya, İran, Kafkasya, Balkanlar, Ege Dünyası ve Doğu Akdeniz çevre kültürlerini kapsayacak şekilde, arkeolojinin sunduğu teoriler, yöntemler ve teknikler aracılığıyla anlamaları için gerekli bilgi ve becerileri kazandırmaktır. Program kapsamında, öğrenciler arkeolojinin temel kavramlarını, teorilerini ve yöntemlerini öğrenmekte, arkeolojik buluntuları ve eserleri tanımlama, sınıflandırma ve analiz etme becerisi kazanmakta, arkeolojik verileri yorumlama ve sunma becerilerini geliştirmekte, eleştirel düşünme, problem çözme ve araştırma becerilerini pekiştirmektedir. Bunlara ek olarak program, mezunlarının müze, kazı, kamu kurumu ve özel sektörde çalışabilecekleri bilgi ve becerileri kazanmasını sağlamakta, arkeolojik mirası koruma ve tanıtma konusunda bilinçlenmelerini desteklemekte, farklı kültürlere saygıyı ve anlayışı teşvik etmektedir.