Bilgisayar Mühendisliği Bölümü, bilgisayar yazılımı, bilgisayar donanımı ve bilgisayar bilimleri alanlarında lisansüstü dersler önermekte ve araştırma olanakları sunmaktadır.
Bu programın amacı, mezun olan bir öğrenciye bilgisayar yazılımı, bilgisayar donanımı veya bilgisayar bilimlerinden bir alanda uzmanlık yetkinliğinin kazandırılmasıdır. Mezun kişiye gerçek dünya problemlerine bilimsel bakabilme, literatür taraması yapabilme, gerekli gözlemleri yapabilme ve elde edilen bilgileri analiz edebilme yeteneğinin kazandırılması amaçlanmaktadır.