PAÜ .:. Eğitim Öğretim Bilgi Sistemi

Yazdır

DERS BİLGİLERİ

Ders Kod	Ders Ad	T+U Saat	Yarıyıl	AKTS
BIO 513	BİYOKİMYADA BİYOİNFORMATİK UYGULAMALARI	3 + 0	2. Yarıyıl	7,5

DERS TANIMI

Ders Düzeyi	Doktora
Ders Türü	Seçmeli
Dersin Amacı	Protein sekans dizileri, moleküler filogenetik, yapısal biyoinformatik, protein-protein etkileşimleri gibi biyokimyada biyoinformatik uygulamalar hakkında bilgiler vermektir.
Ders İçeriği	Protein ikincil yapı tahminleri, Protein üçüncül yapı tahminleri, Karşılaştırılmalı modelleme, Protein yapı görselleştirmeleri, Proteomikte Bioinformatik uygulamaları, Proteinlerin Sınıflandırılması, Post-translasyonel değişikler, Protein-Protein etkileşimleri, Bioinformatik Uygulamalar: redicting Proteinin Hücreici yerinin tahmini, Yapıya dayalı ilaç dizaynı, Moleküler Filogenetik.
Ders Ön Koşul	Dersin ön koşulu yok.
Ders Yan Koşul	Dersin yan koşulu yok.
Öğretim Sistemi	Yüz Yüze

DERS ÖĞRENME KAZANIMLARI

1	Protein ikincil ve üçüncül yapılarını bilir
2	Karşılaştırılmalı modelleme yapar
3	Proteomikte Bioinformatik uygulamaları bilir
4	Proteinlerin Sınıflandırılması bilir
5	Protein-protein etkileşimlerini çözer
6	Yapıya dayalı ilaç dizaynı yapar
7	Moleküler Filogenetik analizi yapar

DERS ÖĞRENME KAZANIMININ PROGRAM YETERLİLİKLERİNE KATKISI

No	PY 01	PY 02	PY 03	PY 04	PY 05	PY 06	PY 07	PY 08	PY 09	PY 10	PY 11
ÖK 001	4	3	3	3	5			3	5	1
ÖK 002	5	2	2	4	5			4	5	1
ÖK 003	5	4	3	3	5			3	5	1
ÖK 004	4	4	4	5	5			3	5	1
ÖK 005	5	5	2	3	5			4	4	1
ÖK 006	5	4	3	5	5			3	4	1
ÖK 007	5	3	4	4	5			2	4	1
Ara Toplam	33	25	21	27	35			22	32	7
Katkı	5	4	3	4	5	0	0	3	5	1	0

AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU

Etkinlik	Sayısı	Süresi (Saat)	Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi(14 hafta/teorik+uygulama)	14	3	42
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme)	14	7	98
Ödevler	1	5	5
Arasınavlar(hazırlık süresi dahil)	1	15	15
Yarıyıl Sonu Sınavı(hazırlık süresi dahil)	1	35	35
Toplam İş Yükü Dersin AKTS Kredisi			195 7,5

DERS ŞUBELERİ

Dönem seçiniz :

Yazdır

Ders Şube Detayları

Dersin Kodu	Dersin Ad	Saat (T+P)	Şube No	Öğretim Dili	Şube Dönemi
BIO 513	BİYOKİMYADA BİYOİNFORMATİK UYGULAMALARI	3 + 0	1	Türkçe	2014-2015 Bahar

Öğretim Elemanı	E-Posta	İç Hat	Ders Yeri	Devam Zorunluluğu
Prof. Dr. ŞEVKİ ARSLAN	sevkia@pau.edu.tr		FEN B0308	Dersin Devam Yüzdesi : %

Amaç		Protein sekans dizileri, moleküler filogenetik, yapısal biyoinformatik, protein-protein etkileşimleri gibi biyokimyada biyoinformatik uygulamalar hakkında bilgiler vermektir.
İçerik		Protein ikincil yapı tahminleri, Protein üçüncül yapı tahminleri, Karşılaştırılmalı modelleme, Protein yapı görselleştirmeleri, Proteomikte Bioinformatik uygulamaları, Proteinlerin Sınıflandırılması, Post-translasyonel değişikler, Protein-Protein etkileşimleri, Bioinformatik Uygulamalar: redicting Proteinin Hücreici yerinin tahmini, Yapıya dayalı ilaç dizaynı, Moleküler Filogenetik.

Haftalık Konu Başlıkları

Hafta	Konular
1	Protein Yapısı
2	Protein ikincil yapı
3	Protein üçüncül yapı tahminleri
4	Karşılaştırılmalı modelleme
5	Protein yapı görselleştirmeleri
6	Proteomikte Bioinformatik uygulamaları
7	Proteinlerin Sınıflandırılması
8	Post-translasyonel değişikler
9	Protein-Protein etkileşimleri
10	Bioinformatik Uygulamalar
11	Ara sınav
12	Yapıya dayalı ilaç dizaynı
13	Moleküler Filogenetik
14	Sunumlar

Materyaller

Materyal belirtilmemiştir.

Kaynaklar

Ders Değerlendirme Sistemi

Değerlendirme Yöntemi	Katkı Yüzdesi (%)	Değerlendirme Yöntemi Ad
Dönem Sonu Sınavı	50	Dönem Sonu Sınavı
Ara Sınav	50	Ara Sınav

T+U : Teorik + Pratik
PY: Program Yeterlilikleri
ÖK: Ders Öğrenme Kazanımları

Aday Öğrenci